Genetics and Genomics Serviço de design de capa de jornal (GWAS)

Journal of Genetics and Genomics

3 February 2023

Análises genômicas e transcriptômicas permitem a identificação de importantes genes associados à deposição de gordura subcutânea em vacas holandesas

Hailiang Zhang^a,1, Siyuan Mi^a,1, Luiz F. Brito^b, Lirong Hu^a, Lei Wang^a, Longgang Ma^a, Qing Xu^c, Gang Guo^d, Ying Yu^a,*, Yachun Wang^a,*

10.1016/j.jgg.2023.01.011

Os principais objetivos deste estudo são identificar os principais genes candidatos que regulam a deposição de gordura subcutânea em vacas leiteiras de alta produção, integrando conjuntos de dados genômicos e transcriptômicos. Um total de 1.654 vacas holandesas genotipadas são utilizadas para realizar um estudo de associação genômica ampla (GWAS) com o objetivo de identificar genes associados à deposição de gordura subcutânea. Posteriormente, análises ponderadas de redes de co-expressão gênica (WGCNA) são conduzidas com base em dados de sequenciamento de RNA de 34 vacas e desvios de rendimento de vacas de deposição de gordura subcutânea. Por último, mRNA diferencialmente expresso (DE), lncRNA e genes de splicing diferencialmente alternativos são obtidos para 12 vacas holandesas com fenótipos extremos e divergentes para deposição de gordura subcutânea. Integrando todas as descobertas, os genes NID2, STARD3, UFC1, DEDD, PPP1R1B e USP21 são considerados os genes candidatos mais importantes que influenciam as características de deposição de gordura subcutânea em vacas holandesas.