Nucleic Acids Research
11 July 2022
Um algoritmo de agrupamento de transformação e sua aplicação no perfil estrutural de polirribossomos
Wenhong Jiang1, Jonathan Wagner2,3, Wenjing Du1, Juergen Plitzko4, Wolfgang Baumeister2, Florian Beck4 and Qiang Guo1,5
1 Laboratório Chave Estadual de Pesquisa de Proteínas e Genes Vegetais, Centro de Ciências da Vida de Pequim-Tsinghua, Academia de Estudos Interdisciplinares Avançados, Escola de Ciências da Vida, Universidade de Pequim, Pequim 100871, China,
2 Departamento de Biologia Molecular Estrutural, Instituto Max Planck de Bioquímica, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Alemanha,
3 Departamento de Bioquímica Celular, Instituto Max Planck de Bioquímica, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Alemanha,
4 Tecnologia CryoEM, Instituto Max Planck de Bioquímica, Am Klopferspitz 18, 82152 Martinsried, Alemanha,
5 Laboratório Changping, Pequim, China
10.1093/nar/gkac547
Melhorias na preparação de amostras de tomografia crioeletrônica, instrumentações de microscopia eletrônica e algoritmos de processamento de imagem avançaram na análise estrutural de macromoléculas in situ. Além dessas análises de macromoléculas individuais, o estudo de suas interações com vizinhos funcionalmente relacionados em habitats celulares lotados, ou seja, "sociologia molecular", é de fundamental importância na biologia. Aqui apresentamos um algoritmo NEighboring Molecule TOpology Clustering (NEMO-TOC). Otimizamos esse algoritmo para a detecção e perfil de polirribossomos, que desempenham papéis constitutivos e reguladores na expressão gênica. Nossos resultados sugerem um modelo onde os polissomos são formados pela conexão de múltiplos blocos não estocásticos, nos quais a tradução é provavelmente sincronizada.
Nosso horário
Seg, 21/11 - Quarta, 23/11: 9h - 20h
Qui, 24/11: fechado - Feliz Dia de Ação de Graças!
Sexta-feira, 25/11: 8h - 22h
Sábado, 26/11 - Dom, 27/11: 10h - 21h
(todos os horários são horário do leste)